RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM50Q86XT4 487 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 WDR18Q9BV38 432 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRVP-201ENST00000482597 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 MYH2Q9UKX2 1941 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 GRIN3BO60391 1043 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP9AO75110 1047 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SNHG28P0DPA3 235 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 TTLL4Q14679 1199 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 NAA25Q14CX7 972 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 ZSCAN26Q16670 478 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PASD1Q8IV76 773 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SCFD1Q8WVM8 642 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC114Q96M63 670 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 EFCC1Q9HA90 598 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SPC25Q9HBM1 224 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 EBAG9O00559 213 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 YARSP54577 528 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP63Q96MT8 703 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PXMP2Q9NR77 195 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 ITGB5P18084 799 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 OAS2P29728 719 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 DSG3P32926 999 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PDE6CP51160 858 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 VAMP7P51809 220 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 HERVK_113P62684 666 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PARP2Q9UGN5 583 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 TISP43B9A030 160 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 CASP5P51878 434 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PGM5Q15124 567 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 MAPK6Q16659 721 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 LY6KQ17RY6 165 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 CDCA5Q96FF9 252 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SPATC1LQ9H0A9 340 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 CDC23Q9UJX2 597 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 NCK2O43639 380 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 TNNC2P02585 160 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 IVLP07476 585 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 MYL3P08590 195 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SIAH1Q8IUQ4 282 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 C7orf31Q8N865 590 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SEPT1Q8WYJ6 367 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 CBWD1Q9BRT8 395 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PLVAPQ9BX97 442 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 CPA4Q9UI42 421 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PDXKO00764 312 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SERPING1P05155 500 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 VAV2P52735 878 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PTK2Q05397 1052 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 XKR3Q5GH77 459 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 OTUD6BQ8N6M0 293 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 NEK9Q8TD19 979 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 AMFRQ9UKV5 643 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 H0YCG3 227 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA8SH3BPF8 625 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 FERP16591 822 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 TFDP1Q14186 410 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM132BQ14DG7 1078 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP1R7Q15435 360 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 CFAP221Q4G0U5 840 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 KLRG1Q96E93 195 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 PI4K2AQ9BTU6 479 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLPH3Q9H4A6 298 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNG1Q9UIX4 513 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 FHOD1Q9Y613 1164 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 M0QZ92 97 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 NEBLO76041 1014 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF18P17022 549 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 MCM3P25205 808 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 GUCY2FP51841 1108 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 MFAP3P55082 362 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 TREML2Q5T2D2 321 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRVP-201ENST00000482597 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms