RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.08■□□□□ 0.97
UPP1-211ENST00000482015 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
UPP1-211ENST00000482015 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.08■□□□□ 0.97
UPP1-211ENST00000482015 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.08■□□□□ 0.97
UPP1-211ENST00000482015 TTC28Q96AY4 2481 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 WNT7AO00755 349 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 FGFR1P11362 822 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 KCNA5P22460 613 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 NPEPPSP55786 919 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 TRIM29Q14134 588 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 EPHA7Q15375 998 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 RGL1Q9NZL6 768 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 MUC3AQ02505 3323 aa21.07■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 WDR81Q562E7 1941 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 ITGB1P05556 798 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 DNM2P50570 870 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 GUCY1B3Q02153 619 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 CAMK1Q14012 370 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 P2RX5Q93086 422 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 KIF2CQ99661 725 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 HCSTQ9UBK5 93 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.06■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 A0A087WZ62 844 aa21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 DNAJB1P25685 340 aa21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 KSR1Q8IVT5 923 aa21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 DYDC2Q96IM9 177 aa21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 CEP170P1Q96L14 293 aa21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 LXNQ9BS40 222 aa21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB39O15060 712 aa21.04■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 CDC42EP1Q00587 391 aa21.04■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 CYP4A11Q02928 519 aa21.04■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.04■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.04■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 C4orf19Q8IY42 314 aa21.04■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 CALCRLQ16602 461 aa21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 TPH2Q8IWU9 490 aa21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 RNF169Q8NCN4 708 aa21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 NLRP4Q96MN2 994 aa21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 RNF19AQ9NV58 838 aa21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 CLDND1Q9NY35 253 aa21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.03■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 SLITRK3O94933 977 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 ATP2B1P20020 1258 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 IRS1P35568 1242 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 TXKP42681 527 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 HYAL1Q12794 435 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 ZNF410Q86VK4 478 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 NEK9Q8TD19 979 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 POF1BQ8WVV4 589 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 TMEM143Q96AN5 459 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 CASD1Q96PB1 797 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 IGFLR1Q9H665 355 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.02■□□□□ 0.96
UPP1-211ENST00000482015 NEMFO60524 1076 aa21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 COL19A1Q14993 1142 aa21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 XKR9Q5GH70 373 aa21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.01■□□□□ 0.95
UPP1-211ENST00000482015 C8orf76Q96K31 380 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms