RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 CST5P28325 142 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 LBX1P52954 281 aa26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 STX17P56962 302 aa26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 CHMP4BP1P59074 171 aa26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 PPFIA1Q13136 1202 aa26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 DRP2Q13474 957 aa26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 STIM1Q13586 685 aa26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 NCAPHQ15003 741 aa26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 SCFD1Q8WVM8 642 aa26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 NELFBQ8WX92 580 aa26.79■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 ARL2P36404 184 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 PEX3P56589 373 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 RTP1P59025 263 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 PAK1Q13153 545 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 GRIK4Q16099 956 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 CXCL17Q6UXB2 119 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 ZNF720Q7Z2F6 126 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 LRRC71Q8N4P6 559 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 GRPEL1Q9HAV7 217 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 PSMA7O14818 248 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 GCNT3O95395 438 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 KLRC1P26715 233 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 PPP1R2P41236 205 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 KCNA10Q16322 511 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 MARCH8Q5T0T0 291 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 KATNAL1Q9BW62 490 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.889e-7■■■■□ 20.7
NME4-209ENST00000460297 UNC93B1Q9H1C4 597 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 C17orf75Q9HAS0 396 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-209ENST00000460297 IKBKBO14920 756 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 ZEB2O60315 1214 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 NPTX2P47972 431 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 MYL5Q02045 173 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 STRA6Q9BX79 667 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 SETD4Q9NVD3 440 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 TRIM49BA6NDI0 452 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 BECN2A8MW95 431 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 ASGR1P07306 291 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 MAPTP10636 758 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 HOXD13P35453 343 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 EFCAB12Q6NXP0 572 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 MTHFD1LQ6UB35 978 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 LMBR1Q8WVP7 490 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 NRCAMQ92823 1304 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 PPP1R37O75864 691 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 GLRA2P23416 452 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 NCKAP1LP55160 1127 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 KCNA1Q09470 495 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 MTFR1Q15390 333 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 IER5Q5VY09 327 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 LINC01465Q8N7H1 131 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 SPIRE2Q8WWL2 714 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 P2RX5Q93086 422 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 RRN3P2A6NIE6 340 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 K7ENM7 598 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 SLC16A4O15374 487 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 MAGEB2O15479 319 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 CCNE1P24864 410 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 HIC1Q14526 733 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 BMT2Q1RMZ1 405 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 CENPPQ6IPU0 288 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 RNF180Q86T96 592 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 METTL13Q8N6R0 699 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 TCP11Q8WWU5 503 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 KIFC3Q9BVG8 833 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 CCDC169A6NNP5 214 aa26.73■■□□□ 1.87
NME4-209ENST00000460297 CLCN3P51790 818 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms