RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A087WZ62 844 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 DGKIO75912 1065 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 NPAS4Q8IUM7 802 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM192Q8IY95 271 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 NLRC5Q86WI3 1866 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 DARSP14868 501 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 TECP42680 631 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 DSC3Q14574 896 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 MCTP1Q6DN14 999 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 RGS18Q9NS28 235 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 ARID2Q68CP9 1835 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 OR52Z1P0C646 297 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00271P0C7V0 271 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 DNM2P50570 870 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 NLRP4Q96MN2 994 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 C9IYK1 514 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 CSPG5O95196 566 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 CTNNB1P35222 781 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 ODR4Q5SWX8 454 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5-208ENST00000459627 MED24O75448 989 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 STAG3L1P0CL83 205 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 MCM2P49736 904 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 GPM6BQ13491 265 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 EMC2Q15006 297 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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SH3BP5-208ENST00000459627 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.68■■□□□ 1.86
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SH3BP5-208ENST00000459627 RNF169Q8NCN4 708 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF3AQ9Y496 699 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 TBKBP1A7MCY6 615 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 H3BQV1 296 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 LYPLA2O95372 231 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAPPC10P48553 1259 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 NEK9Q8TD19 979 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 SAMD11Q96NU1 681 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 H3BNC9 293 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 BMPR1AP36894 532 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM189BP81408 668 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 PTGDRQ13258 359 aa26.66■■□□□ 1.86
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SH3BP5-208ENST00000459627 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
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SH3BP5-208ENST00000459627 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF410Q86VK4 478 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF19AQ9NV58 838 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 GRM6O15303 877 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 RARRES1P49788 294 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 IL17AQ16552 155 aa26.64■■□□□ 1.86
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