RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 DARSP14868 501 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 CTNNB1P35222 781 aa28.91■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 ZNF174Q15697 407 aa28.91■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 NOSTRINQ8IVI9 506 aa28.91■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 IL27Q8NEV9 243 aa28.91■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 THEGQ9P2T0 379 aa28.91■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa28.91■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa28.91■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 SLITRK3O94933 977 aa28.9■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 GATMP50440 423 aa28.9■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 SLC24A5Q71RS6 500 aa28.9■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 RHPN2Q8IUC4 686 aa28.9■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 SLC7A3Q8WY07 619 aa28.9■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 LMCD1Q9NZU5 365 aa28.9■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 CUL9Q8IWT3 2517 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 POTEMA6NI47 508 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 C9IYK1 514 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 DLL1O00548 723 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 ZBTB39O15060 712 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 FGFR4P22455 802 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 GPM6BQ13491 265 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 DSC3Q14574 896 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 XKR9Q5GH70 373 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 TTC38Q5R3I4 469 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 OTUD6AQ7L8S5 288 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 PPME1Q9Y570 386 aa28.89■■■□□ 2.22
CITED1-210ENST00000454225 A0A087WZ62 844 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 LINC00271P0C7V0 271 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 RFC5P40937 340 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 MCM2P49736 904 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 CDC42EP1Q00587 391 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 KSR1Q8IVT5 923 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 NEK9Q8TD19 979 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 NLRP4Q96MN2 994 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 HSD17B14Q9BPX1 270 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 KIF3AQ9Y496 699 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 VCANP13611 3396 aa28.87■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 H3BNC9 293 aa28.87■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 TMEM143Q96AN5 459 aa28.87■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 RWDD3Q9Y3V2 267 aa28.87■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 ARID2Q68CP9 1835 aa28.87■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 OR52Z1P0C646 297 aa28.86■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 BMPR1AP36894 532 aa28.86■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 NBR1Q14596 966 aa28.86■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 ZNF410Q86VK4 478 aa28.86■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 EXOC8Q8IYI6 725 aa28.86■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 TRAPPC10P48553 1259 aa28.85■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 EMC2Q15006 297 aa28.85■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 PTPROQ16827 1216 aa28.85■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa28.85■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 MYO7AQ13402 2215 aa28.85■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 C5orf67F2Z3F1 127 aa28.84■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 LYPLA2O95372 231 aa28.84■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 TECP42680 631 aa28.84■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 FAM102BQ5T8I3 360 aa28.84■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa28.84■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 TMEM161AQ9NX61 479 aa28.84■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 BRWD1Q9NSI6 2320 aa28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 TBKBP1A7MCY6 615 aa28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 RB1P06400 928 aa28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 FGFR1P11362 822 aa28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 GJB2P29033 226 aa28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 FAM189BP81408 668 aa28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 KIAA1671Q9BY89 1806 aa28.83■■■□□ 2.21
CITED1-210ENST00000454225 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.2
CITED1-210ENST00000454225 TJAP1Q5JTD0 557 aa28.82■■■□□ 2.2
CITED1-210ENST00000454225 MCTP1Q6DN14 999 aa28.82■■■□□ 2.2
CITED1-210ENST00000454225 PIGOQ8TEQ8 1089 aa28.82■■■□□ 2.2
CITED1-210ENST00000454225 MTRQ99707 1265 aa28.82■■■□□ 2.2
CITED1-210ENST00000454225 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CITED1-210ENST00000454225 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CITED1-210ENST00000454225 ANKEF1Q9NU02 776 aa28.82■■■□□ 2.2
CITED1-210ENST00000454225 A0A087WWV3 80 aa28.81■■■□□ 2.2
CITED1-210ENST00000454225 GAS2O43903 313 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
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