RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 BMP8BP34820 402 aa12.26□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 GPC3P51654 580 aa12.26□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 MCM6Q14566 821 aa12.26□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 NLRP4Q96MN2 994 aa12.26□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A087WZ62 844 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 PPP6R2O75170 966 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 EYA4O95677 639 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 FGBP02675 491 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 GLRA2P23416 452 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 ARL2P36404 184 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 RFC5P40937 340 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 ME1P48163 572 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC12A3P55017 1021 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 NUCB2P80303 420 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 DEFB103AP81534 67 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa12.25□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa12.25□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 IER5Q5VY09 327 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 RSPH3Q86UC2 560 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 DAW1Q8N136 415 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 NME8Q8N427 588 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 PDILTQ8N807 584 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC01599Q8WXQ3 324 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC7A3Q8WY07 619 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 AK8Q96MA6 479 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 MAP7D2Q96T17 732 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 MTRQ99707 1265 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 CCSER1Q9C0I3 900 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 TMX1Q9H3N1 280 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 MINDY3Q9H8M7 445 aa12.25□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa12.25□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 SFI1A8K8P3 1242 aa12.24□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 MGEA5O60502 916 aa12.24□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 CYP11B2P19099 503 aa12.24□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 TMOD1P28289 359 aa12.24□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 KRT85P78386 507 aa12.24□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 FAM102BQ5T8I3 360 aa12.24□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf186Q6ZWK4 172 aa12.24□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 NLRP7Q8WX94 980 aa12.24□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 STAMQ92783 540 aa12.24□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa12.24□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 SPATA32Q96LK8 384 aa12.24□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 IFT122Q9HBG6 1241 aa12.24□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa12.23□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNG4Q8TDN1 519 aa12.23□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 HERVK_113Q902F9 699 aa12.23□□□□□ -0.45
RPRD1B-202ENST00000449186 RAD54LQ92698 747 aa12.23□□□□□ -0.45
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RPRD1B-202ENST00000449186 ERVK-5Q9HDB9 667 aa12.23□□□□□ -0.45
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