RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 RAB34Q9BZG1 259 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 TLL1O43897 1013 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 MGEA5O60502 916 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 AMHP03971 560 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 CA3P07451 260 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 RFC5P40937 340 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 PDIA5Q14554 519 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 SPRED2Q7Z698 418 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 MTRQ99707 1265 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 CERS4Q9HA82 394 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ENPP3O14638 875 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 SPECC1Q5M775 1068 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 KRT79Q5XKE5 535 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 NACC1Q96RE7 527 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 USP28Q96RU2 1077 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 EVPLQ92817 2033 aa22.86■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 E9PMD0 336 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 EFCAB14O75071 495 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 RAB30Q15771 203 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 USP38Q8NB14 1042 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.85■■□□□ 1.25
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PTX4-203ENST00000447419 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.85■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 GJB5O95377 273 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTX4-203ENST00000447419 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 KCNK18Q7Z418 384 aa22.84■■□□□ 1.25
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PTX4-203ENST00000447419 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ZNF576Q9H609 170 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.84■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 PTPAQ15257 358 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ADAM2Q99965 735 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 SQORQ9Y6N5 450 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 DENND3A2RUS2 1198 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 GPR182O15218 404 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 DGAT1O75907 488 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 GRIN2CQ14957 1233 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 PADI6Q6TGC4 694 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 RNF149Q8NC42 400 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 CLIC6Q96NY7 704 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 PNMA5Q96PV4 448 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 TOP1MTQ969P6 601 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 PPME1Q9Y570 386 aa22.82■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 PTPRSQ13332 1948 aa22.81■■□□□ 1.24
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PTX4-203ENST00000447419 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 GRB10Q13322 594 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 GPR153Q6NV75 609 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 USP49Q70CQ1 688 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 CABP7Q86V35 215 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 TCP11Q8WWU5 503 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 GUCD1Q96NT3 240 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 YME1L1Q96TA2 773 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 CSRNP2Q9H175 543 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.81■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 BMP15O95972 392 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 F13A1P00488 732 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 GATMP50440 423 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 RAD9AQ99638 391 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 DNM3Q9UQ16 869 aa22.8■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 RFXAPO00287 272 aa22.79■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 GLRA2P23416 452 aa22.79■■□□□ 1.24
PTX4-203ENST00000447419 ARL2P36404 184 aa22.79■■□□□ 1.24
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