RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438233.2

CYCSP43-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 43, humanhuman

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Gene CYCSP43, Length 310 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP43-201ENST00000438233 FOXB2Q5VYV0 432 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 PRR23CQ6ZRP0 262 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 MFSD4AQ8N468 514 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 BTN2A2Q8WVV5 523 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 NINJ1Q92982 152 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 CCDC140Q96MF4 163 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 TEPSINQ96N21 525 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 RPS6KC1Q96S38 1066 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 GDF15Q99988 308 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 JADE2Q9NQC1 790 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 CHST7Q9NS84 486 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 IFT57Q9NWB7 429 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.72□□□□□ -1.65
CYCSP43-201ENST00000438233 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.72□□□□□ -1.65
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CYCSP43-201ENST00000438233 GSC2O15499 205 aa4.71□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 TBX1O43435 398 aa4.71□□□□□ -1.66
CYCSP43-201ENST00000438233 LRRN2O75325 713 aa4.71□□□□□ -1.66
CYCSP43-201ENST00000438233 USP2O75604 605 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 GSNP06396 782 aa4.71□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 ITIH2P19823 946 aa4.71□□□□□ -1.66
CYCSP43-201ENST00000438233 HOXC12P31275 282 aa4.71□□□□□ -1.66
CYCSP43-201ENST00000438233 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 CCDC96Q2M329 555 aa4.71□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa4.71□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.71□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 LGR4Q9BXB1 951 aa4.71□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP43-201ENST00000438233 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP43-201ENST00000438233 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP43-201ENST00000438233 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
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CYCSP43-201ENST00000438233 DEFB123Q8N688 67 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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