RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 AMHP03971 560 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TRAPPC10P48553 1259 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 RABGGTBP53611 331 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 PSMC5P62195 406 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 NHLH1Q02575 133 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 XKR3Q5GH77 459 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TMX3Q96JJ7 454 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MTMR9Q96QG7 549 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CEP89Q96ST8 783 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 RAD9AQ99638 391 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 PPME1Q9Y570 386 aa9.92□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 USP34Q70CQ2 3546 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 EML1O00423 815 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 WNT7AO00755 349 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TLL1O43897 1013 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 NEMFO60524 1076 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CA3P07451 260 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 GHRP10912 638 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 EPHA7Q15375 998 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TOP1MTQ969P6 601 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.91□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 GPR32O75388 356 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 LYPLA2O95372 231 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MYOGP15173 224 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TMOD1P28289 359 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 GUCY1B3Q02153 619 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TAP1Q03518 808 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CALCRLQ16602 461 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 ANO5Q75V66 913 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 C4orf19Q8IY42 314 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 NEK9Q8TD19 979 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MAP7D2Q96T17 732 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MFRPQ9BY79 579 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 INSL6Q9Y581 213 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.9□□□□□ -0.82
LINC00963-204ENST00000427778 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 MYO7AQ13402 2215 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 CD52P31358 61 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 CLCN3P51790 818 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 FOSBP53539 338 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 CDC42EP1Q00587 391 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 PAK2Q13177 524 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 ODR4Q5SWX8 454 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 METTL13Q8N6R0 699 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 BANK1Q8NDB2 785 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 HLA-CQ95604 372 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 LXNQ9BS40 222 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 KCNH6Q9H252 994 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 ADAMTS10Q9H324 1103 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 PADI3Q9ULW8 664 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.89□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 LCHNA4D1U4 455 aa9.88□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 LINC01553A4QN01 128 aa9.88□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 ENPP3O14638 875 aa9.88□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 MARCH6O60337 910 aa9.88□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 ARHGEF15O94989 841 aa9.88□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 RFC5P40937 340 aa9.88□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 ERVK-21P61565 698 aa9.88□□□□□ -0.83
LINC00963-204ENST00000427778 CUL4AQ13619 759 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms