RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRRX2Q99811 253 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf50Q9HD87 102 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKT3Q9Y243 479 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIDE1A8MVS5 230 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR16Q569H4 304 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABI1Q8IZP0 508 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF558Q96NG5 402 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHOX2BQ99453 314 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S1PR5Q9H228 398 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAMM50Q9Y512 469 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NID2Q14112 1375 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.9□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR64B1ANS9 1081 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OATP04181 439 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMOD1P28289 359 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNA11P29992 359 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CIITAP33076 1130 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PBX3P40426 434 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGD1P98174 961 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCF15Q12870 199 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPN21Q16825 1174 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LENG9Q96B70 501 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASIC4Q96FT7 647 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPC3P51654 580 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKCEQ02156 737 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOL5Q9BWW9 433 aa14.89□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF862O60290 1169 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPA1P15085 419 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT17Q04695 432 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMC7Q7Z402 723 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF169Q8NCN4 708 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BICD2Q8TD16 824 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASP10Q92851 521 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCLT1Q96NL6 688 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DISC1Q9NRI5 854 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPG21Q9NZD8 308 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.88□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZUG5 572 aa14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB33Q86T24 672 aa14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SKAP1Q86WV1 359 aa14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HELQQ8TDG4 1101 aa14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRF1Q92994 677 aa14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHKBQ93100 1093 aa14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.87□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0U1RQF3 1178 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSH4O15457 936 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHMP2AO43633 222 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC45O75419 566 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGCGQ16739 394 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRP7Q8WX94 980 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DACT1Q9NYF0 836 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH22Q9UJ99 828 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR2E1Q9Y466 385 aa14.86□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAS7O60861 476 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EOMESO95936 686 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGFR4P22455 802 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFNP31947 248 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JAK3P52333 1124 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC5A5Q92911 643 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIT2Q99578 217 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.85□□□□□ -0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms