RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964		K7ENM7	598 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	HAS3	O00219	553 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	C22orf31	O95567	290 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	CASP5	P51878	434 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	RTP1	P59025	263 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	IGBP1	P78318	339 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	IQCB1	Q15051	598 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	LRRC41	Q15345	812 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	GRIK4	Q16099	956 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	UBE4B	O95155	1302 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	BECN2	A8MW95	431 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	IKBKB	O14920	756 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	KIF20A	O95235	890 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	GCNT3	O95395	438 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MYB	P10242	640 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	PEX3	P56589	373 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	STX17	P56962	302 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MYL5	Q02045	173 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	FIZ1	Q96SL8	496 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SI	P14410	1827 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MAGEB2	O15479	319 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	ARL2	P36404	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	NPTX2	P47972	431 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	ALCAM	Q13740	583 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	RNF180	Q86T96	592 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	P2RX5	Q93086	422 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MED15	Q96RN5	788 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	EVPL	Q92817	2033 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC169	A6NNP5	214 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC16A4	O15374	487 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP1R37	O75864	691 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	ASGR1	P07306	291 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	GLRA2	P23416	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	CCNE1	P24864	410 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	KLRC1	P26715	233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MRE11	P49959	708 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	CLCN3	P51790	818 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SMTN	P53814	917 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	DRP2	Q13474	957 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	NCAPH	Q15003	741 aa		13.59	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms