RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 ODR4Q5SWX8 454 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 FIBCD1Q8N539 461 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 NEK9Q8TD19 979 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 LPXNO60711 386 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 DGKIO75912 1065 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 RFC5P40937 340 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 EMC2Q15006 297 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 RGS18Q9NS28 235 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 MYO9BQ13459 2157 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 EVPLQ92817 2033 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 MED24O75448 989 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 STAG3L1P0CL83 205 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 EPC2Q52LR7 807 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 C9IYK1 514 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 LYPLA2O95372 231 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 PTGDRQ13258 359 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 DSC3Q14574 896 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM192Q8IY95 271 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRN2-204ENST00000404321 WDR81Q562E7 1941 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 CTNNB1P35222 781 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 CUL4AQ13619 759 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 POTEGQ6S5H5 508 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 ERMNQ8TAM6 284 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 MTRQ99707 1265 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 PPME1Q9Y570 386 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 FGFR1P11362 822 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 RARRES1P49788 294 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 CDC42EP1Q00587 391 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF410Q86VK4 478 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 RNF169Q8NCN4 708 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 PP2D1A8MPX8 630 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 CSPG5O95196 566 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 LINC00271P0C7V0 271 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 GPM6BQ13491 265 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 IL17AQ16552 155 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 FERMT3Q86UX7 667 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 RNF149Q8NC42 400 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 TCP11Q8WWU5 503 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 SAMD11Q96NU1 681 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-204ENST00000404321 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms