RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391019.2

U3.21-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 220 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.21-201ENST00000391019 TRAPPC10P48553 1259 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 LONRF3Q496Y0 759 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 APBB2Q92870 758 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 TOP1MTQ969P6 601 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 YME1L1Q96TA2 773 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 PLIN2Q99541 437 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 RAD9AQ99638 391 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 ADAM2Q99965 735 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 KIF3AQ9Y496 699 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.66□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 VCANP13611 3396 aa11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 EFCAB14O75071 495 aa11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 FGFR1P11362 822 aa11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 TMOD1P28289 359 aa11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 RESTQ13127 1097 aa11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 DSC3Q14574 896 aa11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 KCNK18Q7Z418 384 aa11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 USP20Q9Y2K6 914 aa11.65□□□□□ -0.54
U3.21-201ENST00000391019 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 LPXNO60711 386 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 LYPLA2O95372 231 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 LINC00271P0C7V0 271 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 RARRES1P49788 294 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 GRB10Q13322 594 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 RNF169Q8NCN4 708 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 LRRC15Q8TF66 581 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 SLC7A3Q8WY07 619 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 BSNDQ8WZ55 320 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 LRWD1Q9UFC0 647 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 MTMR6Q9Y217 621 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 CLIC4Q9Y696 253 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 COL4A6Q14031 1691 aa11.64□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 DENND3A2RUS2 1198 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 C9IYK1 514 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 E9PMD0 336 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 DGKIO75912 1065 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 GLRA2P23416 452 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 PKP1Q13835 747 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 OTUD6AQ7L8S5 288 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 IGSF22Q8N9C0 903 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 RNF149Q8NC42 400 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 LPPQ93052 612 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 SNX21Q969T3 373 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 MTRQ99707 1265 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 RNF19AQ9NV58 838 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 INSL6Q9Y581 213 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 SQORQ9Y6N5 450 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 GBF1Q92538 1859 aa11.63□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 TRANK1O15050 2925 aa11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 GPR182O15218 404 aa11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 RPA1P27694 616 aa11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 RFC5P40937 340 aa11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 DNM2P50570 870 aa11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 ERVK-21P61565 698 aa11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 CAPSQ13938 189 aa11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 EPC2Q52LR7 807 aa11.62□□□□□ -0.55
U3.21-201ENST00000391019 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms