RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PSMC5P62195 406 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 COG7P83436 770 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SNX24Q9Y343 169 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ELF1P32519 619 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 AFF2P51816 1311 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 TDP2O95551 362 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 ARL4CP56559 192 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 NFIXQ14938 502 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SHC4Q6S5L8 630 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A1P02730 911 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 HSPH1Q92598 858 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 EFHD1Q9BUP0 239 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PRR29P0C7W0 189 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 KRT39Q6A163 491 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF302Q9NR11 478 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TTC26A0AVF1 554 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 MTRQ99707 1265 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 CIITAP33076 1130 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TMTC4Q5T4D3 741 aa21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PQC6 194 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PP2D1A8MPX8 630 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 AKR1B1P15121 316 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ATG16L1Q676U5 607 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP36Q96G28 342 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 FAF2Q96CS3 445 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRG1Q9Y653 693 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 MED14O60244 1454 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 HUS1O60921 280 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PMLP29590 882 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 KCNB1Q14721 858 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 LXNQ9BS40 222 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.69■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 MGEA5O60502 916 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL4Q14679 1199 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ACAD9Q9H845 621 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PLS3P13797 630 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 CAV1Q03135 178 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PDIA5Q14554 519 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TTC39CQ8N584 583 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 POLD4Q9HCU8 107 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 STAT3P40763 770 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 EPHA7Q15375 998 aa21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 RASIP1Q5U651 963 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 BEST2Q8NFU1 509 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PLAAQ9Y263 795 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 KLC3Q6P597 504 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 CRB1P82279 1406 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 WDR91A4D1P6 747 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TEX33O43247 280 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 KCNQ2O43526 872 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 GDAP1Q8TB36 358 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 UBE4BO95155 1302 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ALKQ9UM73 1620 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 F8W8V4 182 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SRGAP2O75044 1071 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 KRT38O76015 456 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 CASP2P42575 452 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms