RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 MT-ND3P03897 115 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 WHAMMQ8TF30 809 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 WDR91A4D1P6 747 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 PHKA2P46019 1235 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.61■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 NR1D1P20393 614 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 VAMP7P51809 220 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 IL25Q9H293 177 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 FMO2Q99518 471 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 GINM1Q9NU53 330 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 KRT3P12035 628 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 DPF2Q92785 391 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SERPINB6P35237 376 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 HIP1RO75146 1068 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 MTA3Q9BTC8 594 aa22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 A0A0G2JLW4 131 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 TOM1L1O75674 476 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SLMAPQ14BN4 828 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 EMBQ6PCB8 327 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 TNFAIP2Q03169 654 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SPATA33Q96N06 139 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 CAMTA2O94983 1202 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ACSL3O95573 720 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 BNIP3LO60238 219 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SFNP31947 248 aa22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 SLC12A1Q13621 1099 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 MIPOL1Q8TD10 442 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 NEK9Q8TD19 979 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 FAF2Q96CS3 445 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ACAD9Q9H845 621 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 FLT1P17948 1338 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 RASGRF2O14827 1237 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 MTMR2Q13614 643 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 TTLL4Q14679 1199 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 LDHDQ86WU2 507 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 TLK1Q9UKI8 766 aa22.58■■□□□ 1.21
SMURF1-201ENST00000361125 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.58■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.58■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 NCK2O43639 380 aa22.58■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 HMGCS2P54868 508 aa22.58■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 CEP120Q8N960 986 aa22.58■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 FAM205CA6NFA0 338 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 PSMC5P62195 406 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 GPC5P78333 572 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 DBN1Q16643 649 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 WDR24Q96S15 920 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 TJP3O95049 919 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 GGCXP38435 758 aa22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.56■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 GNAT1P11488 350 aa22.56■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 IRX4P78413 519 aa22.56■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 PCGF5Q86SE9 256 aa22.56■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 TTC36A6NLP5 189 aa22.56■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 HPS3Q969F9 1004 aa22.56■■□□□ 1.2
SMURF1-201ENST00000361125 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.56■■□□□ 1.2
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