RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 HOXA2O43364 376 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 SFNP31947 248 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 TBCKQ8TEA7 893 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC5A5Q92911 643 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 MUC6Q6W4X9 2439 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 EDIL3O43854 480 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 GPC3P51654 580 aa28.24■■■□□ 2.11
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PPP4R4-202ENST00000328839 NLRP7Q8WX94 980 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 CASD1Q96PB1 797 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
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PPP4R4-202ENST00000328839 FGFR4P22455 802 aa28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 DUSP6Q16828 381 aa28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 HFE2Q6ZVN8 426 aa28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 RUFY3Q7L099 469 aa28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ECHDC2Q86YB7 292 aa28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF710Q8N1W2 664 aa28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC43Q8N309 656 aa28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 RNF19AQ9NV58 838 aa28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.23■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 FSD2A1L4K1 749 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 CPLX1O14810 134 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 SRGAP2BP0DMP2 458 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 PBX3P40426 434 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 EVCP57679 992 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 MTERF2Q49AM1 385 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC55Q6ZSA7 311 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 VN1R2Q8NFZ6 395 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF558Q96NG5 402 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 TCF25Q9BQ70 676 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.22■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 FSCN2O14926 492 aa28.21■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 TDP2O95551 362 aa28.21■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 DARSP14868 501 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNT2Q6UVM3 1135 aa28.21■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 LZTS1Q9Y250 596 aa28.21■■■□□ 2.11
PPP4R4-202ENST00000328839 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 PSMD10O75832 226 aa28.2■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 PLCB3Q01970 1234 aa28.2■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 Q4G0T1 1027 aa28.2■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.2■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa28.2■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa28.2■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM150BA6NC51 233 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 LOC730098B7Z3J9 87 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 DEXIO95424 95 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 PPM1AP35813 382 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 KRT17Q04695 432 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 STK3Q13188 491 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 DRP2Q13474 957 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 CLLU1OSQ5K130 101 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 BLIDQ8IZY5 108 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 RDM1Q8NG50 284 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 HELQQ8TDG4 1101 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 EDAQ92838 391 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 SH2D3AQ9BRG2 576 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa28.19■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIOO75962 3097 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 TECP42680 631 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 TMC7Q7Z402 723 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 MFSD14AQ96MC6 490 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 APOL5Q9BWW9 433 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 DACT1Q9NYF0 836 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 SPG21Q9NZD8 308 aa28.18■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 TECTAO75443 2155 aa28.17■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 HIDE1A8MVS5 230 aa28.17■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 CA8P35219 290 aa28.17■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 DNM2P50570 870 aa28.17■■■□□ 2.1
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PPP4R4-202ENST00000328839 XKR3Q5GH77 459 aa28.17■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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PPP4R4-202ENST00000328839 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A0U1RQF3 1178 aa28.16■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXL18Q96ME1 805 aa28.16■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 EOMESO95936 686 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP3A7P24462 503 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKRD54Q6NXT1 300 aa28.15■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
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