RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 MGAT3Q09327 533 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 MCM6Q14566 821 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 KIZQ2M2Z5 673 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 SCLT1Q96NL6 688 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GVL5 298 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 CMA1P23946 247 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 MBTPS1Q14703 1052 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 RINT1Q6NUQ1 792 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 DHX58Q96C10 678 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 RFC2P35250 354 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 KSR1Q8IVT5 923 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 NLRP7Q8WX94 980 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 POLD4Q9HCU8 107 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 NBNO60934 754 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 GPR32O75388 356 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 PFKFB1P16118 471 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 GPC3P51654 580 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 GPBP1Q86WP2 473 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 NLRP4Q96MN2 994 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 OSMRQ99650 979 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PQ27 194 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PQ64 194 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PQD8 194 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 ACRP10323 421 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 GHRP10912 638 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 GPNMBQ14956 572 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 FSIP1Q8NA03 581 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 IQUBQ8NA54 791 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 IL23AQ9NPF7 189 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 A0A087WZ62 844 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 ARL2P36404 184 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 CDC42EP1Q00587 391 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 SV2BQ7L1I2 683 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 KCND2Q9NZV8 630 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 ASAP2O43150 1006 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 EPHB4P54760 987 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 E2F4Q16254 413 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 GDF15Q99988 308 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD4-201ENST00000306324 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 HIP1RO75146 1068 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 GLRA2P23416 452 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 GUCY2CP25092 1073 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 LPIN1Q14693 890 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 ARSHQ5FYA8 562 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF410Q86VK4 478 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 RNF149Q8NC42 400 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 KIFAP3Q92845 792 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CXCL10P02778 98 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 PFKMP08237 780 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 NDUFA8P51970 172 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 TFDP1Q14186 410 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 VWCEQ96DN2 955 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 DRC1Q96MC2 740 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 TIPINQ9BVW5 301 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CUEDC2Q9H467 287 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 HPSEQ9Y251 543 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 SYKP43405 635 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CAPSQ13938 189 aa24.74■■□□□ 1.55
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