RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEB2O15479 319 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PI15O43692 258 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP9AO75110 1047 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT37O76014 449 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NPR3P17342 541 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTR2P61160 394 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC42EP1Q00587 391 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 LETM2Q2VYF4 491 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL13Q8N6R0 699 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF169Q8NCN4 708 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SCLT1Q96NL6 688 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CASD1Q96PB1 797 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K14Q99558 947 aa8.96□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMA4Q16363 1823 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIOO75962 3097 aa8.95□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 CFHP08603 1231 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 WEE2P0C1S8 567 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CTSAP10619 480 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SRFP11831 508 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGB5P18084 799 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 KLRC2P26717 231 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF76P36508 570 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEA9P43362 315 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 BCAR1P56945 870 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC23AQ15436 765 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 KIZQ2M2Z5 673 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM228AQ86W67 206 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 OSMRQ99650 979 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 BCO2Q9BYV7 579 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBP1Q9H171 429 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF302Q9NR11 478 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.95□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0U1RQF3 1178 aa8.94□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 LAMTOR5O43504 91 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CYTH3O43739 400 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 DDAH1O94760 285 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SP9P0CG40 484 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CALM1P0DP23 149 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CALM2P0DP24 149 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CALM3P0DP25 149 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 EPCAMP16422 314 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 DMWDQ09019 674 aa8.94□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN14Q15678 1187 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SPECC1Q5M775 1068 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.94□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 FAM167AQ96KS9 214 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CHST12Q9NRB3 414 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB23Q9ULC3 237 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CA14Q9ULX7 337 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.93□□□□□ -0.98
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