RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 CTSAP10619 480 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 EPCAMP16422 314 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 BCAR1P56945 870 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 NCOA7Q8NI08 942 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 LNPKQ9C0E8 428 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 SENP2Q9HC62 589 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 STK39Q9UEW8 545 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 R4GN57 208 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.86□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 A0A0U1RQF3 1178 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 UBE2SQ16763 222 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 LETM2Q2VYF4 491 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CLLU1OSQ5K130 101 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 KANK3Q6NY19 840 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ABHD15Q6UXT9 468 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 NXPE3Q969Y0 559 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ZNF302Q9NR11 478 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 DACT1Q9NYF0 836 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.85□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 MAGEB2O15479 319 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 C22orf31O95567 290 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 VTNP04004 478 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CFHP08603 1231 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CYP21A2P08686 494 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 SP9P0CG40 484 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 TMOD1P28289 359 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CEP55Q53EZ4 464 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ZNF654Q8IZM8 581 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 METTL13Q8N6R0 699 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 RNF169Q8NCN4 708 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 HELQQ8TDG4 1101 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 STAMQ92783 540 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 MAP7D2Q96T17 732 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 ACACBO00763 2458 aa11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
USP41-201ENST00000292729 KRBA1A5PL33 1030 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 MEIS1O00470 390 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 KINO60870 393 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 ARP10275 920 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 SRFP11831 508 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 TMTC2Q8N394 836 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 AUTS2Q8WXX7 1259 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 IGSF21Q96ID5 467 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 MTA3Q9BTC8 594 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 DPP7Q9UHL4 492 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.83□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 E7EWF7 191 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 CCNE2O96020 404 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 CALM1P0DP23 149 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 CALM2P0DP24 149 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 CALM3P0DP25 149 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 SKIP12755 728 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 KLRC2P26717 231 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 CLCN4P51793 760 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 PTPN14Q15678 1187 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 KIAA0319Q5VV43 1072 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 NIPA1Q7RTP0 329 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 DCLK2Q8N568 766 aa11.82□□□□□ -0.52
USP41-201ENST00000292729 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms