RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256474.2

VHL-201, Transcript of von Hippel-Lindau tumor suppressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VHL, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHL-201ENST00000256474 PHLPP1O60346 1717 aa14.65□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 SPOPO43791 374 aa14.65□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 MARCKSL1P49006 195 aa14.65□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.65□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 EPC2Q52LR7 807 aa14.65□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.65□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VHL-201ENST00000256474 DLG4P78352 724 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 VPS72Q15906 364 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FMO2Q99518 471 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 EPN3Q9H201 632 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FGFR4P22455 802 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CDR1P51861 262 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 DR1Q01658 176 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ZNF844Q08AG5 666 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PBKQ96KB5 322 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CCDC17Q96LX7 622 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ISCUQ9H1K1 167 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 A0A1W2PRG0 241 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PDXKO00764 312 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 TGFB1I1O43294 461 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FMO5P49326 533 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 C18orf8Q96DM3 657 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.64□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CCDC169A6NNP5 214 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 MMP10P09238 476 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ARP10275 920 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FERP16591 822 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SOX5P35711 763 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ITIH3Q06033 890 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 LRRC14Q15048 493 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 QPCTQ16769 361 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 AOC3Q16853 763 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SHBGP04278 402 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 KRT35Q92764 455 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.63□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 EMSYQ7Z589 1322 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CAND2O75155 1236 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CHRNA5P30532 468 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SAAL1Q96ER3 474 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 WDR18Q9BV38 432 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 CD248Q9HCU0 757 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 USP20Q9Y2K6 914 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 F8VZ95 297 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 RAD17O75943 681 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 KRT5P13647 590 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 E2F5Q15329 346 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.62□□□□□ -0.07
VHL-201ENST00000256474 SCN7AQ01118 1682 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms