RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.17■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.17■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 SERINC5Q86VE9 423 aa22.17■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.17■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.17■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.17■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 CD4P01730 458 aa22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 GLRA2P23416 452 aa22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 ASIC1P78348 528 aa22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 TNS4Q8IZW8 715 aa22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 FIZ1Q96SL8 496 aa22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.16■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.15■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF131P52739 623 aa22.15■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 EHHADHQ08426 723 aa22.15■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.15■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 SPATA20Q8TB22 786 aa22.15■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 MAGEB2O15479 319 aa22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 IDEP14735 1019 aa22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 TLE2Q04725 743 aa22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 ISM2Q6H9L7 571 aa22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 SFR1Q86XK3 245 aa22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 KCND2Q9NZV8 630 aa22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 PPME1Q9Y570 386 aa22.14■■□□□ 1.14
KDELR3-201ENST00000216014 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 BMP6P22004 513 aa22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 RTP1P59025 263 aa22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 COASYQ13057 564 aa22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 CAPSQ13938 189 aa22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 PANK4Q9NVE7 773 aa22.14■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 CASP5P51878 434 aa22.13■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 FAAP100Q0VG06 881 aa22.13■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.13■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 KANK3Q6NY19 840 aa22.13■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.13■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.13■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 SCN5AQ14524 2016 aa22.13■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.13■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 BIN1O00499 593 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 GNAT1P11488 350 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 AMPD3Q01432 767 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 IER5Q5VY09 327 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 UNC13DQ70J99 1090 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 AKT3Q9Y243 479 aa22.12■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 GPR32O75388 356 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 NPTX2P47972 431 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 PEX3P56589 373 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 KIZQ2M2Z5 673 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 RETREG2Q8NC44 543 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 FAM13AO94988 1023 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 EDN1P05305 212 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 CTSHP09668 335 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 PLS3P13797 630 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 PTMSP20962 102 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 PTK7Q13308 1070 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 MYCT1Q8N699 235 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 USP20Q9Y2K6 914 aa22.11■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 CHRNA1P02708 482 aa22.1■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 GPC3P51654 580 aa22.1■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 STK4Q13043 487 aa22.1■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.1■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.1■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.1■■□□□ 1.13
KDELR3-201ENST00000216014 KIFAP3Q92845 792 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms