RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000167825.5

ARHGEF10L-201, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like, humanhuman

TSL 2

Gene ARHGEF10L, Length 3,018 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ARHGEF10L-201ENST00000167825 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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ARHGEF10L-201ENST00000167825 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 PALMO75781 387 aa14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 GAP43P17677 238 aa14.63□□□□□ -0.07
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ARHGEF10L-201ENST00000167825 KCNA1Q09470 495 aa14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 KCNMA1Q12791 1236 aa14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 PARVGQ9HBI0 331 aa14.63□□□□□ -0.07
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ARHGEF10L-201ENST00000167825 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 C19orf81C9J6K1 198 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 NNTQ13423 1086 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 TRADDQ15628 312 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
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ARHGEF10L-201ENST00000167825 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 PXMP2Q9NR77 195 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 PDXKO00764 312 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 ERLIN2O94905 339 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.62□□□□□ -0.07
ARHGEF10L-201ENST00000167825 ALS2CLQ60I27 953 aa14.62□□□□□ -0.07
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