RNA–Protein interactions for RNA: YOR174W

MED4, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene MED4, Length 855 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MED4	YOR174W	PTP1	P25044	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	HXT1	P32465	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	VAM7	P32912	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	TPO5	P36029	618 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	CHK1	P38147	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	YNL260C	P53846	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	YNL050C	P53952	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	BCH1	Q05029	724 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	LDB17	Q12342	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	AHC1	Q12433	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	SPO14	P36126	1683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	BNI1	P41832	1953 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
MED4	YOR174W	CAP2	P13517	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	ECT1	P33412	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	PCI8	P40512	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	CAF40	P53829	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	FMP42	Q04991	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	FMP16	Q12497	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED4	YOR174W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	SPR1	P32603	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	YHR182W	P38870	785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	PET100	P38958	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RBG1	P39729	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	NDE2	Q07500	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RAX1	Q08760	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	CSM1	P25651	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	TIR2	P33890	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	PMU1	P36069	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	GPX2	P38143	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	PEX32	P38292	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	YHK8	P38776	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RTT101	P47050	842 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	NAS6	P50086	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	HER2	Q03557	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RRN11	Q04712	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	BCP1	Q06338	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	AFT2	Q08957	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RAD7	P06779	565 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	ATR1	P13090	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	UTR1	P21373	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	GPI12	P23797	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	SPS22	P25380	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	NAT2	P37293	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	IML3	P38265	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	YAP3	P38749	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	DSE1	P40077	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	YGL242C	P53066	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	LST7	P53237	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	GOR1	P53839	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	ARV1	Q06541	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	SRB8	P25648	1427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RAD1	P06777	1100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RSR1	P13856	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	COY1	P34237	679 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	ASK1	P35734	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	MTC6	P38849	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	ATG7	P38862	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
MED4	YOR174W	FHL1	P39521	936 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RCY1	P39531	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	YIL169C	P40442	995 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	YIL152W	P40455	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	TAF6	P53040	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	RTT103	Q05543	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	FAR1	P21268	830 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MED4	YOR174W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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