RNA–Protein interactions for RNA: YMR065W

KAR5, Transcript of Protein required for nuclear membrane fusion during karyogamy, yeast

Gene KAR5, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR5	YMR065W	YPQ1	Q12010	308 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	FSH3	Q99369	266 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	DAP2	P18962	818 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	MRPS9	P38120	278 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YHR182W	P38870	785 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YNR068C	P53754	272 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	FSH2	Q05015	223 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YDL109C	Q12103	647 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	MCT1	Q12283	360 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	SFM1	Q12314	213 aa		3.44	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	BMT2	P38278	337 aa		3.43	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	PEX22	P39718	180 aa		3.43	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ECM11	Q04110	302 aa		3.43	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YLR177W	Q06251	628 aa		3.43	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.43	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	DPH2	P32461	534 aa		3.42	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	VAM7	P32912	316 aa		3.42	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	BLI1	P35727	113 aa		3.42	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	PGU1	P47180	361 aa		3.42	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	VHT1	P53241	593 aa		3.42	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	GAS2	Q06135	555 aa		3.42	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	GLE1	Q12315	538 aa		3.42	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	COS9	P36034	407 aa		3.41	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YKR015C	P36111	568 aa		3.41	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YGR018C	P53211	109 aa		3.41	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	VAC7	P53950	1165 aa		3.41	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	AIM33	Q04516	312 aa		3.41	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	BPT1	P14772	1559 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	RDS1	P25611	832 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ECT1	P33412	323 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YBR241C	P38142	488 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YJR030C	P47101	745 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YDR115W	Q04598	105 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	YPR078C	Q06813	372 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ATP16	Q12165	160 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	LDB17	Q12342	491 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	HIF1	Q12373	385 aa		3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
KAR5	YMR065W	ATG2	P53855	1592 aa		3.4	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	MAS1	P10507	462 aa		3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	SWI3	P32591	825 aa		3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	ANP1	P32629	500 aa		3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	HEM14	P40012	539 aa		3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	YDL012C	Q12489	107 aa		3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	HMX1	P32339	317 aa		3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	RBG1	P39729	369 aa		3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	SLT2	Q00772	484 aa		3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	NFI1	Q12216	726 aa		3.39	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	CKI1	P20485	582 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	TOA1	P32773	286 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	APE4	P38821	490 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	AIM23	P47015	356 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	LST7	P53237	242 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	SMP3	Q04174	516 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	UBA3	Q99344	299 aa		3.38	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	UNG1	P12887	359 aa		3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	GRR1	P24814	1151 aa		3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	YFL012W	P43580	148 aa		3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	FLC3	P53121	802 aa		3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	YNL143C	P53908	130 aa		3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	RNH201	P53942	307 aa		3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	AQR1	P53943	586 aa		3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	SRO7	Q12038	1033 aa		3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	SFG1	Q12507	346 aa		3.37	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	PDC2	P32896	925 aa		3.36	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	VEL1	P53058	206 aa		3.36	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	YOR012W	Q12351	137 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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