RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	YER186C	P40101	306 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	KEG1	P43614	200 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SDT1	P53078	280 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	HST1	P53685	503 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	GLE1	Q12315	538 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	HIR3	P47171	1648 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	NUP2	P32499	720 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SRB2	P34162	210 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YHC3	P47040	408 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	ARR1	Q06596	294 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	MCT1	Q12283	360 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	MXR2	P25566	168 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	LDB16	P25587	256 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	PRR1	P28708	518 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SUR1	P33300	382 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	SDS24	P38314	527 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YJR030C	P47101	745 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	TIS11	P47977	285 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	LST7	P53237	242 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	YET2	Q04210	160 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	NAT4	Q04751	285 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RPC17	YJL011C	UTR1	P21373	530 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	IST2	P38250	946 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YHR182W	P38870	785 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YLR152C	P54072	576 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	STE23	Q06010	1027 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	APC5	Q08683	685 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	SLM3	Q12093	417 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	STF1	P01098	86 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RAD1	P06777	1100 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	CIN8	P27895	1000 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	TIM17	P39515	158 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YCH1	P42937	148 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YNL146W	P53906	100 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	MGR3	Q04472	501 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	LIP2	Q06005	328 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	HEM4	P06174	275 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	CDC50	P25656	391 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	PEX32	P38292	413 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	OM14	P38325	134 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	PFS1	P38872	237 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YMR134W	P40207	237 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	OSW5	P40219	148 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	SHE10	P53075	577 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YGL114W	P53134	725 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	VAC7	P53950	1165 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	CSM3	Q04659	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	GAL3	P13045	520 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	PCH2	P38126	564 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	ABZ2	Q03266	374 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	VPS20	Q04272	221 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	MSC3	Q05812	728 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	UBA3	Q99344	299 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	PCL1	P24867	279 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	MKK1	P32490	508 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YKR015C	P36111	568 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RBG1	P39729	369 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	DFG10	P40526	253 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	NAS6	P50086	228 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YMR010W	Q03687	405 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	TSA2	Q04120	196 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	ATP16	Q12165	160 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RGS2	Q99188	309 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	PRB1	P09232	635 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	CMK2	P22517	447 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	GIT1	P25346	518 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	PES4	P39684	611 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	AIM20	P40451	204 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YOR376W	Q08900	122 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	FRE8	Q12209	686 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	SFM1	Q12314	213 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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