RNA–Protein interactions for RNA: YGR169C

PUS6, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS6, Length 1,215 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS6	YGR169C	YHR177W	P38867	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	FAD1	P38913	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	FMP52	P40008	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	HPM1	P40481	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PMT4	P46971	762 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	APS3	P47064	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YJR120W	P47157	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	LCL3	P53153	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	GET1	P53192	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ACL4	Q03771	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YKU80	Q04437	629 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MDM30	Q05930	598 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YPS7	Q06325	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	OSW1	Q08692	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MLH3	Q12083	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PMR1	P13586	950 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	UGA1	P17649	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CTR86	P25355	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	VPS51	P36116	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	STP2	P38704	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TRR2	P38816	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
PUS6	YGR169C	MTW1	P39731	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ALG5	P40350	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	AAD10	P47182	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TOM22	P49334	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YNL033W	P53964	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YNL019C	P53975	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SKS1	Q12505	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PUT2	P07275	575 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MSS18	P08593	268 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	GAL3	P13045	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	AAC3	P18238	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SEC62	P21825	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CLB3	P24870	427 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TFC1	P32367	649 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MOH1	P38191	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TDP1	P38319	544 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	RIC1	P40395	1056 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	MAM33	P40513	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CUP9	P41817	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	BIT61	P47041	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CDH1	P53197	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	GPI1	P53306	609 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	DSL1	P53847	754 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SUR7	P54003	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	YMR102C	Q03177	834 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SMA2	Q04658	369 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	SPC2	Q04969	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	AKR2	Q12013	749 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	ACF2	Q12168	779 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	TPO4	Q12256	659 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUS6	YGR169C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	MER1	P16523	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	PTR2	P32901	601 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	YBR139W	P38109	508 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	FES1	P38260	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	YHR218W	P38899	603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	RBG1	P39729	369 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	JEM1	P40358	645 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	YGR201C	P42936	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	MDV1	P47025	714 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	IKS1	P47042	667 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	YNR068C	P53754	272 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	SPO77	Q06134	477 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	RRT8	Q08219	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	THP1	Q08231	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUS6	YGR169C	ULA1	Q12059	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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