RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W CAP2P13517 287 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RPB5P20434 215 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MNE1P24720 663 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PUP2P32379 260 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W YEF1P32622 495 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MDL1P33310 695 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W SKT5P34226 696 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MRPL4P36517 319 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W QDR3P38227 689 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W GDI1P39958 451 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W JEM1P40358 645 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W EFM4P40516 257 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W STE24P47154 453 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MRM2P53123 320 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W COS1P53822 381 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W LOT6Q07923 191 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PLP2Q12017 286 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RNH203Q12338 110 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W JID1Q12350 301 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RPL12BP0CX54 165 aa3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W COX13P32799 129 aa3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W CSE2P33308 149 aa3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MLH1P38920 769 aa3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W ROG1P53118 685 aa3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W YLR152CP54072 576 aa3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W URC2Q04411 772 aa3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MYO1P08964 1928 aa3.31□□□□□ -1.88
SPT15YER148W NAM2P11325 894 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MSI1P13712 422 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W BUD2P33314 1104 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W SEC28P40509 296 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W SHY1P53266 389 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MEH1Q02205 184 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W YMR102CQ03177 834 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W SMC5Q08204 1093 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W CCH1P50077 2039 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MOT1P32333 1867 aa3.3□□□□□ -1.88
SPT15YER148W ARF1P11076 181 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W YSC83P32792 385 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W COY1P34237 679 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W GAB1P41733 394 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W ASN2P49090 572 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MLC1P53141 149 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W YGR266WP53326 701 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RTT102P53330 157 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RRN9P53437 365 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RCF1Q03713 159 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PRM6Q04705 352 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RIF2Q06208 395 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W AAD15Q08361 143 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W IZH2Q12442 317 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W SRN2Q99176 213 aa3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PIS1P06197 220 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W SLM5P25345 492 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PRR1P28708 518 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W HXT1P32465 570 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W TOA2P32774 122 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W YHK8P38776 514 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PES4P39684 611 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W AIM10P39965 576 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MAM33P40513 266 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W AIM24P47127 394 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PMT5P52867 743 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W MST27P53176 234 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W ALF1P53904 254 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W SPR6Q01684 191 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W ADD37Q03233 198 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W ECM7Q06200 448 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W IPK1Q06667 281 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W YOP1Q12402 180 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W EAF3Q12432 401 aa3.28□□□□□ -1.88
SPT15YER148W OPI3P05375 206 aa3.27□□□□□ -1.89
SPT15YER148W DOA1P36037 715 aa3.27□□□□□ -1.89
SPT15YER148W ATM1P40416 690 aa3.27□□□□□ -1.89
SPT15YER148W HAC1P41546 238 aa3.27□□□□□ -1.89
SPT15YER148W YFR057WP43625 151 aa3.27□□□□□ -1.89
SPT15YER148W LCB3P47013 409 aa3.27□□□□□ -1.89
SPT15YER148W TOS2P50078 622 aa3.27□□□□□ -1.89
SPT15YER148W CLD1P53264 445 aa3.27□□□□□ -1.89
SPT15YER148W ADA2Q02336 434 aa3.27□□□□□ -1.89
SPT15YER148W TDA1Q03533 586 aa3.27□□□□□ -1.89
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