RNA–Protein interactions for RNA: YDR545W

YRF1-1, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-1, Length 5,391 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-1YDR545W YOR012WQ12351 137 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W STE12P13574 688 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W COQ2P32378 372 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W IXR1P33417 597 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W SPT10P35208 640 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YNK1P36010 153 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W GLC8P41818 229 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W PHO23P50947 330 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W FSH3Q99369 266 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YKR051WP36142 418 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W MNT3P40549 630 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YOL114CQ12322 202 aa7.29□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W SEC59P20048 519 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W ADE1P27616 306 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YBR053CP38235 358 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W TPO3Q06451 622 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YPR084WQ06821 456 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YRF1-3P0CX14 1859 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YRF1-7P0CX15 1859 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YRF1-6P53819 1859 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W MER1P16523 270 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W ASC1P38011 319 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W FUI1P38196 639 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YIL165CP40446 119 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W PAC10P48363 199 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W EAF3Q12432 401 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W SHE1P38200 338 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W CDC1P40986 491 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W MRX5P47007 382 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W HXT5P38695 592 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W RPE1P46969 238 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W FIG2P25653 1609 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W CDC28P00546 298 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W AMD1P15274 810 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W RBK1P25332 333 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YCR061WP25639 631 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W MSK1P32048 576 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W SUR1P33300 382 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W LOT5P34234 306 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W EDC3P39998 551 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W UFE1P41834 346 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W EMI1Q04406 187 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W YDL086WQ07505 273 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W GUP2Q08929 609 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W BTS1Q12051 335 aa7.28□□□□□ -1.24
YRF1-1YDR545W ULI1P43604 169 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W SNG1P46950 547 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W PET130P47065 347 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W ANT1Q06497 328 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W SFP1P32432 683 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W BAP2P38084 609 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W YHR122WP38829 231 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W MEP1P40260 492 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W EXG2P52911 562 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W NCS6P53088 359 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W RSM27P53305 110 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W DGK1Q12382 290 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W APA2P22108 325 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W PRE4P30657 266 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W OCA5P38738 679 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W SSU1P41930 458 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W TAD2P47058 250 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W AAD10P47182 288 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W TDH1P00360 332 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W ALG3P38179 458 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W IST3P40565 148 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W IDS2P46958 469 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W AIM24P47127 394 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W YNR062CP53748 327 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W MRPL15P36523 253 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W EMC5P40540 141 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W SDT1P53078 280 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W YGL159WP53110 370 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W MSC2Q03455 724 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W APN1P22936 367 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W VRP1P37370 817 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W YPR022CQ12139 1133 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W ELO3P40319 345 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W HXT14P42833 540 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W DLD2P46681 530 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W RPN4Q03465 531 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W YLR173WQ06247 608 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W RDS2P19541 446 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W MRPL4P36517 319 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W AIM14P53109 570 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W AAT1Q01802 451 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W OAZ1Q02803 292 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W YPR063CQ12160 140 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W YPR011CQ12251 326 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W CTF3Q12748 733 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-1YDR545W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18 ms