RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC169	A6NNP5	214 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KCNK3	O14649	394 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KCNQ3	O43525	872 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AGT	P01019	485 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	T-ENOL	P0DO92	83 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PYGM	P11217	842 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ITGA4	P13612	1032 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLRC1	P26715	233 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SERPINB3	P29508	390 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HDAC4	P56524	1084 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RCN1	Q15293	331 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTI2	Q6NXR4	508 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KSR2	Q6VAB6	950 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BRINP3	Q76B58	766 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	INPP5D	Q92835	1189 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ABHD8	Q96I13	439 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRIM47	Q96LD4	638 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SETDB2	Q96T68	719 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRT82	Q9NSB4	513 aa		9.44	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LRRC53	A6NM62	1247 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KRT36	O76013	467 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATF3	P18847	181 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GALK1	P51570	392 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EMP3	P54852	163 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KCNMA1	Q12791	1236 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NAB2	Q15742	525 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC6	Q16204	474 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLC3	Q6P597	504 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERP27	Q96DN0	273 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FMO2	Q99518	471 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	COPRS	Q9NQ92	184 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATP9B	O43861	1147 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TBX10	O75333	385 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ASMTL	O95671	621 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ALDH2	P05091	517 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CREB1	P16220	341 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLCO1A2	P46721	670 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAP7	Q14244	749 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC29A2	Q14542	456 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USH1G	Q495M9	461 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NEK9	Q8TD19	979 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TEKT1	Q969V4	418 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HAUS1	Q96CS2	278 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DYDC2	Q96IM9	177 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		9.42	□□□□□ -0.9

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