RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 ATP9AO75110 1047 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 DEXIO95424 95 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 SREBF1P36956 1147 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 DUSP6Q16828 381 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM50Q86XT4 487 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 BICD2Q8TD16 824 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 PFKFB2O60825 505 aa21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 CDKL5O76039 1030 aa21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 KCNA2P16389 499 aa21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF76P36508 570 aa21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 NLRP5P59047 1200 aa21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.79■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 MAFGO15525 162 aa21.78■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 GRIK4Q16099 956 aa21.78■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 CEP55Q53EZ4 464 aa21.78■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.78■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.78■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.78■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 PAK2Q13177 524 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 CRIPAKQ8N1N5 446 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-208ENST00000608287 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.77■■□□□ 1.08
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SGMS1-208ENST00000608287 CD52P31358 61 aa21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 ODR4Q5SWX8 454 aa21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 CES5AQ6NT32 575 aa21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.76■■□□□ 1.07
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SGMS1-208ENST00000608287 LZTS1Q9Y250 596 aa21.76■■□□□ 1.07
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SGMS1-208ENST00000608287 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.75■■□□□ 1.07
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SGMS1-208ENST00000608287 TECP42680 631 aa21.75■■□□□ 1.07
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SGMS1-208ENST00000608287 CASP10Q92851 521 aa21.74■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 SDF4Q9BRK5 362 aa21.74■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 S1PR5Q9H228 398 aa21.74■■□□□ 1.07
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SGMS1-208ENST00000608287 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.73■■□□□ 1.07
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SGMS1-208ENST00000608287 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.73■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 GTF3C6Q969F1 213 aa21.73■■□□□ 1.07
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SGMS1-208ENST00000608287 STK36Q9NRP7 1315 aa21.73■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.72■■□□□ 1.07
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SGMS1-208ENST00000608287 LAG3P18627 525 aa21.72■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.72■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 BLIDQ8IZY5 108 aa21.72■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 NME8Q8N427 588 aa21.72■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.72■■□□□ 1.07
SGMS1-208ENST00000608287 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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