RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAP43P17677 238 aa12.89□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRERF1Q96PN7 1200 aa12.89□□□□□ -0.35
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFT81Q8WYA0 676 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACBD3Q9H3P7 528 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCIF1Q9H4Z3 704 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MED4Q9NPJ6 270 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAMM50Q9Y512 469 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNA3P22001 575 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CARSP49589 748 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOOK2Q96ED9 719 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MXRA8Q9BRK3 442 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEKT3Q9BXF9 490 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STK32BQ9NY57 414 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa12.88□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FRMPD4Q14CM0 1322 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF35A5YM69 484 aa12.87□□□□□ -0.35
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FMO5P49326 533 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CXCL9Q07325 125 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZSCAN26Q16670 478 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HS2ST1Q7LGA3 356 aa12.87□□□□□ -0.35
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYCP3Q8IZU3 236 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FEM1BQ9UK73 627 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GOLGA6BA6NDN3 693 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF131P52739 623 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GUCY2DQ02846 1103 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAF1Q13077 416 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAPK7Q13164 816 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGAP44Q17R89 818 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 B3GNT9Q6UX72 402 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLHL7Q8IXQ5 586 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTKN2Q8IZC4 609 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EPB41L5Q9HCM4 733 aa12.87□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NFU1Q9UMS0 254 aa12.87□□□□□ -0.35
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EXOC3O60645 756 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM153BP0C7A2 387 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTGER2P43116 358 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLG4P78352 724 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS6KA1Q15418 735 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM153CQ494X1 144 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUM1L1Q5H9M0 696 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PADI6Q6TGC4 694 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIER3Q7Z3K6 550 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM160B2Q86V87 743 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM153AQ9UHL3 310 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSKSQ9UJT2 592 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYH11P35749 1972 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATAD5Q96QE3 1844 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLOT1O75955 427 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASNSP08243 561 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKCIP41743 596 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RASA3Q14644 834 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SKIDA1Q1XH10 827 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXR1Q6PIV2 292 aa12.86□□□□□ -0.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLEC4DQ8WXI8 215 aa12.86□□□□□ -0.35
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