RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598539.5

FCHO1-225, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-225ENST00000598539 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.68□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.68□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 AZI2Q9H6S1 392 aa14.68□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.68□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 FAM186AA6NE01 2351 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 PER2O15055 1255 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 LARGE1O95461 756 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 MARK3P27448 753 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 TECP42680 631 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 ID4P47928 161 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 IGBP1P78318 339 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 NME8Q8N427 588 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM260Q9NX78 707 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 PADI3Q9ULW8 664 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 LZTS1Q9Y250 596 aa14.67□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 ESYT2A0FGR8 921 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 DENND3A2RUS2 1198 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 FGF18O76093 207 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 LAG3P18627 525 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 NAPAP54920 295 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 SEMA3FQ13275 785 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 CASP10Q92851 521 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 PHKBQ93100 1093 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 TMX3Q96JJ7 454 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 BARHL2Q9NY43 387 aa14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 MAFGO15525 162 aa14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 PPM1AP35813 382 aa14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 KRT17Q04695 432 aa14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 ITIH3Q06033 890 aa14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 NECAB1Q8N987 351 aa14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 BICD2Q8TD16 824 aa14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.65□□□□□ -0.06
FCHO1-225ENST00000598539 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 PIK3CDO00329 1044 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 HOXA2O43364 376 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 INSRRP14616 1297 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 GNA11P29992 359 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 ADCY7P51828 1080 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 KRT76Q01546 638 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 MTMR1Q13613 665 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 BECN1Q14457 450 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 MTHFRP42898 656 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 CLCN5P51795 746 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 TRIM29Q14134 588 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 GALNT17Q6IS24 598 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 TCF25Q9BQ70 676 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 S1PR5Q9H228 398 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 C6orf50Q9HD87 102 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.63□□□□□ -0.07
FCHO1-225ENST00000598539 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms