RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.51□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SPC25Q9HBM1 224 aa9.51□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.51□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.51□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CLIC4Q9Y696 253 aa9.51□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 ARID2Q68CP9 1835 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SORBS3O60504 671 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 NEMFO60524 1076 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 ARP10275 920 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 ITGB5P18084 799 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CIITAP33076 1130 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 PSMC6P62333 389 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 MTMR1Q13613 665 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 STK38Q15208 465 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CALCRLQ16602 461 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 GNPTABQ3T906 1256 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 MORC4Q8TE76 937 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 GJA10Q969M2 543 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 THAP11Q96EK4 314 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC9A7Q96T83 725 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 VTA1Q9NP79 307 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 JADE2Q9NQC1 790 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.5□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 MEIS1O00470 390 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 MSH4O15457 936 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 FIBPO43427 364 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 NR1I2O75469 434 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 STAM2O75886 525 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 RGS20O76081 388 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CYP2C9P11712 490 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CYP3A7P24462 503 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 NKX3-2P78367 333 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 KRT85P78386 507 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 FOXK2Q01167 660 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 ZP2Q05996 745 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 Q4G0T1 1027 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 LENG9Q96B70 501 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 GPRASP2Q96D09 838 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 MBOAT7Q96N66 472 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 KATNBL1Q9H079 304 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SCN5AQ14524 2016 aa9.49□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 GFRA3O60609 400 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 ARIH2O95376 493 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 PFKMP08237 780 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 OR52Z1P0C646 297 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 TXKP42681 527 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SP4Q02446 784 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SEMA3FQ13275 785 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 TAPT1Q6NXT6 567 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SCFD2Q8WU76 684 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 COPS5Q92905 334 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CDHR1Q96JP9 859 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 ALG2Q9H553 416 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CFAP45Q9UL16 551 aa9.48□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 C5orf42Q9H799 3197 aa9.47□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.47□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 SPTLC2O15270 562 aa9.47□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CHMP2AO43633 222 aa9.47□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 GAS7O60861 476 aa9.47□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 ATP9AO75110 1047 aa9.47□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 CABYRO75952 493 aa9.47□□□□□ -0.89
NEDD4L-218ENST00000587547 BMP15O95972 392 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms