RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585714.1

ABCA9-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 9, human

TSL 4

Gene ABCA9, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA9-208	ENST00000585714	CD276	Q5ZPR3	534 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	PROSER1	Q86XN7	944 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	DDX11	Q96FC9	970 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	RNF38	Q9H0F5	515 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	BTBD7	Q9P203	1132 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	INAVA	Q3KP66	663 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	HIPK4	Q8NE63	616 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	JDP2	Q8WYK2	163 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	E2F7	Q96AV8	911 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	SPATA25	Q9BR10	227 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	LCHN	A4D1U4	455 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	KDM1A	O60341	852 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	FBXO21	O94952	628 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	C8B	P07358	591 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	MC3R	P41968	323 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	NEK2	P51955	445 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	MSRA	Q9UJ68	235 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	TNKS	O95271	1327 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCA9-208	ENST00000585714	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	SH3D21	A4FU49	640 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	ZNF839	A8K0R7	811 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	MPIG6B	O95866	241 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	PTGS1	P23219	599 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	EPHB1	P54762	984 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	MCL1	Q07820	350 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	PDCD1	Q15116	288 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	TTC38	Q5R3I4	469 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	WASF3	Q9UPY6	502 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	MC4R	P32245	332 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	THBS2	P35442	1172 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	SCAND1	P57086	179 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	PFKP	Q01813	784 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	VASN	Q6EMK4	673 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	CMIP	Q8IY22	773 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	C7orf31	Q8N865	590 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	MAML3	Q96JK9	1138 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	FOXB1	Q99853	325 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	USP40	Q9NVE5	1235 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	EID1	Q9Y6B2	187 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	SHTN1	A0MZ66	631 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	MARCH6	O60337	910 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	PRL	P01236	227 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	MYBL2	P10244	700 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	CYP2C8	P10632	490 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	INSRR	P14616	1297 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	MOGS	Q13724	837 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	UBXN11	Q5T124	520 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ABCA9-208	ENST00000585714	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		6.94	□□□□□ -1.3

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