RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-205	ENST00000577827	GYG2	O15488	501 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	POLE2	P56282	527 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	RCN2	Q14257	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SBK1	Q52WX2	424 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	FAM170A	A1A519	330 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	MCF2L	O15068	1137 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CCND1	P24385	295 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SOX5	P35711	763 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	GRIN1	Q05586	938 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DBN1	Q16643	649 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SPATA21	Q7Z572	469 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	MS4A14	Q96JA4	679 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	RAD51C	O43502	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SASH3	O75995	380 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TJP3	O95049	919 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TNNC2	P02585	160 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CYP2D6	P10635	497 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	USP11	P51784	963 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	STAT4	Q14765	748 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827		E9PMD0	336 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	RASSF10	A6NK89	507 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827		H7C0C1	242 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	NMT2	O60551	498 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	BMP3	P12645	472 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PLS3	P13797	630 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC16A2	P36021	539 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ATP5O	P48047	213 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	COG7	P83436	770 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CCT6B	Q92526	530 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SNF8	Q96H20	258 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PPL	O60437	1756 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	KRT19	P08727	400 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	KRT39	Q6A163	491 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	RPS6KA5	O75582	802 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	BBOX1	O75936	387 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	HAUS5	O94927	633 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CHN1	P15882	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC12A2	P55011	1212 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ARL4C	P56559	192 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PSMD6	Q15008	389 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63	8e-8	■■■■□ 26

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