RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558816.5

SEMA6D-210, Transcript of semaphorin 6D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SEMA6D, Length 4,419 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6D-210ENST00000558816 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 DPP7Q9UHL4 492 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF536O15090 1300 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 ASAP2O43150 1006 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 NDUFB10O96000 172 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 CMA1P23946 247 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 USP11P51784 963 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 MFAP3P55082 362 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 GNG11P61952 73 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 PPFIA1Q13136 1202 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 PSMD2Q13200 908 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SHISA4Q96DD7 197 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 MAF1Q9H063 256 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.06□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 ROBO3Q96MS0 1386 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SHTN1A0MZ66 631 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 ATP8B1O43520 1251 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 CAP2P40123 477 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 PDE6CP51160 858 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 STAT5BP51692 787 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 ANTXR2P58335 489 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 ADAM9Q13443 819 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 YAF2Q8IY57 180 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 NELFBQ8WX92 580 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 TRIM11Q96F44 468 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 LY9Q9HBG7 655 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 DNAI1Q9UI46 699 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 POLIQ9UNA4 740 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 TRIM17Q9Y577 477 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 PPATQ06203 517 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 DGKDQ16760 1214 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 DACT2Q5SW24 774 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF365Q70YC5 407 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 TIPINQ9BVW5 301 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 EHD4Q9H223 541 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 INTS13Q9NVM9 706 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 GIPC1O14908 333 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 CLDN3O15551 220 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 HUS1O60921 280 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 GGPS1O95749 300 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 BACE1P56817 501 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 MYL7Q01449 175 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 KRT17Q04695 432 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 SEMA3FQ13275 785 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 CEP55Q53EZ4 464 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 EMC10Q5UCC4 262 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 RGMBQ6NW40 437 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 GJA10Q969M2 543 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 MTRQ99707 1265 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 H0YHG0 523 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 FKTNO75072 461 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 PPP6R2O75170 966 aa6.05□□□□□ -1.44
SEMA6D-210ENST00000558816 MMP1P03956 469 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms