RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM23-208	ENST00000553876	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBM23-208	ENST00000553876	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM23-208	ENST00000553876	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBM23-208	ENST00000553876	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM23-208	ENST00000553876	MCM8	Q9UJA3	840 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM23-208	ENST00000553876	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBM23-208	ENST00000553876	MATN2	O00339	956 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	CUTA	O60888	179 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	HMGCR	P04035	888 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ADRB1	P08588	477 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	SCNN1B	P51168	640 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ADAM17	P78536	824 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	DHCR24	Q15392	516 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	SURF1	Q15526	300 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	RNF151	Q2KHN1	245 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	KIF18B	Q86Y91	864 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	DNER	Q8NFT8	737 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ATL2	Q8NHH9	583 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	SAMD11	Q96NU1	681 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	GNRHR2	Q96P88	292 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	CD248	Q9HCU0	757 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	CABP5	Q9NP86	173 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	PRL	P01236	227 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	FNTB	P49356	437 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	MOGS	Q13724	837 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	SLFN13	Q68D06	897 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	CFHR4	Q92496	578 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	USP7	Q93009	1102 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	LOXL4	Q96JB6	756 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	FOXB1	Q99853	325 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	PATE3	B3GLJ2	98 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	GAS7	O60861	476 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	EYA4	O95677	639 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF20	P17024	532 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	RGS3	P49796	1198 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	STAT5B	P51692	787 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	EVA1C	P58658	441 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	DSG1	Q02413	1049 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	CDSN	Q15517	529 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	NXPE1	Q8N323	547 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	FBXO10	Q9UK96	956 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876		A0A0G2JNJ9	132 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876		H7C1D1	291 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	BRINP1	O60477	761 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	F2	P00734	622 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	DUSP8	Q13202	625 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	AGBL4	Q5VU57	503 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	LMF1	Q96S06	567 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	TTC1	Q99614	292 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	IFT22	Q9H7X7	185 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	JADE2	Q9NQC1	790 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM23-208	ENST00000553876	OXSM	Q9NWU1	459 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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