RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551901.5

RRN3P1-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RRN3P1, Length 1,157 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM40Q8WWA1 233 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 LINC01599Q8WXQ3 324 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TMX3Q96JJ7 454 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TMX1Q9H3N1 280 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 INSL6Q9Y581 213 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 COL4A6Q14031 1691 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM150BA6NC51 233 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 M0QZ92 97 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 LPXNO60711 386 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ERVK-21P61565 698 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 METTL13Q8N6R0 699 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 BACH2Q9BYV9 841 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ADAMTS10Q9H324 1103 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 RFXAPO00287 272 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 SLITRK3O94933 977 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 VTNP04004 478 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 MCM2P49736 904 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 CLCN3P51790 818 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 DRP2Q13474 957 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 CALCRLQ16602 461 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 KIZQ2M2Z5 673 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 C4orf19Q8IY42 314 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 HSD17B14Q9BPX1 270 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 CERS4Q9HA82 394 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 RGL1Q9NZL6 768 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 PCDHA12Q9UN75 941 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 NEMFO60524 1076 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 RPS6KA5O75582 802 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 UPP2O95045 317 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 LYPLA2O95372 231 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 LINC00271P0C7V0 271 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TMOD1P28289 359 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 GPC3P51654 580 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 PAK2Q13177 524 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM266Q2M3C6 531 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 MTERF2Q49AM1 385 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM228AQ86W67 206 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 NOSTRINQ8IVI9 506 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ARNTL2Q8WYA1 636 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 DYDC2Q96IM9 177 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 OSMRQ99650 979 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 MTCH2Q9Y6C9 303 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 NLRC5Q86WI3 1866 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ARID2Q68CP9 1835 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 CHD7Q9P2D1 2997 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ZBTB39O15060 712 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 GPR182O15218 404 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 MARCH6O60337 910 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 MGEA5O60502 916 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 DGKIO75912 1065 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 MCM7P33993 719 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TXKP42681 527 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TRAPPC10P48553 1259 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 NPEPPSP55786 919 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM189BP81408 668 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 GRB10Q13322 594 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 DSC3Q14574 896 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 ODR4Q5SWX8 454 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 NCAPH2Q6IBW4 605 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-204ENST00000551901 SLC17A8Q8NDX2 589 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms