RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.45■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 EVPLQ92817 2033 aa23.45■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 MARCH6O60337 910 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 ATP2B1P20020 1258 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 PAK2Q13177 524 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 EPHA7Q15375 998 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 BACH2Q9BYV9 841 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 INSL6Q9Y581 213 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 MGEA5O60502 916 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 MCM7P33993 719 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 FAM228AQ86W67 206 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 DYDC2Q96IM9 177 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 LXNQ9BS40 222 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 AKT3Q9Y243 479 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 LPXNO60711 386 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 IGFBP4P22692 258 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 NPEPPSP55786 919 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 ERVK-21P61565 698 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 CYP4A11Q02928 519 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 MAP7D2Q96T17 732 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 COL4A6Q14031 1691 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 ZBTB39O15060 712 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 RPS6KA5O75582 802 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 TXKP42681 527 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 YME1L1Q96TA2 773 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 TTC3P53804 2025 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 SLITRK3O94933 977 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 TMOD1P28289 359 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 GPC3P51654 580 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 GRB10Q13322 594 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 NBR1Q14596 966 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 ZNF174Q15697 407 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 C4orf19Q8IY42 314 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 IL27Q8NEV9 243 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.39■■□□□ 1.34
CS-222ENST00000550996 POTEMA6NI47 508 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 LINC00271P0C7V0 271 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.38■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 GJB2P29033 226 aa23.38■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 MCM2P49736 904 aa23.38■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 TTC38Q5R3I4 469 aa23.38■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 PPM1EQ8WY54 764 aa23.38■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.38■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.38■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 DSC3Q14574 896 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 TPH2Q8IWU9 490 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 CEP170P1Q96L14 293 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 ADAM2Q99965 735 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 GPR182O15218 404 aa23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 DGKIO75912 1065 aa23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 FGFR4P22455 802 aa23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 GATMP50440 423 aa23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.36■■□□□ 1.33
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