RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526458.1

C9orf135-AS1-203, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PSMD10O75832 226 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TDP2O95551 362 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 VTNP04004 478 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KIZQ2M2Z5 673 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MIER3Q7Z3K6 550 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TMEM40Q8WWA1 233 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 P2RX5Q93086 422 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TTC28Q96AY4 2481 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PHF20Q9BVI0 1012 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 UNC45AQ9H3U1 944 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 AKT3Q9Y243 479 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZNF862O60290 1169 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GPR32O75388 356 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CLCN3P51790 818 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 AK2P54819 239 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 UGCGQ16739 394 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 INF2Q27J81 1249 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NAALADL2Q58DX5 795 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 B3GNT9Q6UX72 402 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 FAM228AQ86W67 206 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LINC01465Q8N7H1 131 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ETNPPLQ8TBG4 499 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 WASF1Q92558 559 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GJA10Q969M2 543 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MBOAT7Q96N66 472 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPP1R16BQ96T49 567 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 RGS18Q9NS28 235 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 C5orf42Q9H799 3197 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NCOR1O75376 2440 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MGEA5O60502 916 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MMP1P03956 469 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KCNA5P22460 613 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LETM2Q2VYF4 491 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LEXMQ3ZCV2 418 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TCEAL5Q5H9L2 206 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NEK8Q86SG6 692 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 LRRC71Q8N4P6 559 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ADAM2Q99965 735 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GRM6O15303 877 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NCK2O43639 380 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GPC3P51654 580 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 XKR3Q5GH77 459 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPP4R3AQ6IN85 833 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NEK9Q8TD19 979 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 C9IYK1 514 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SLC37A4O43826 429 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CDC42EP1Q00587 391 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPP2R5CQ13362 524 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 COL19A1Q14993 1142 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MTERF2Q49AM1 385 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GTF3C6Q969F1 213 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PPP2R3CQ969Q6 453 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 SCLT1Q96NL6 688 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ADAMTS10Q9H324 1103 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 BRMS1Q9HCU9 246 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KCNMB3Q9NPA1 279 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TMEM161AQ9NX61 479 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CLDND1Q9NY35 253 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 PLAGL2Q9UPG8 496 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 MYO7AQ13402 2215 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 BDP1A6H8Y1 2624 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 TBX3O15119 743 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 HOXA2O43364 376 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 CTDNEP1O95476 244 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 KRT2P35908 639 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-203ENST00000526458 GATMP50440 423 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms