RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLN3Q13286 438 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARID5BQ14865 1188 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 LETM2Q2VYF4 491 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ODR4Q5SWX8 454 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 IER5Q5VY09 327 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 POTEBQ6S5H4 581 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 BRAPQ7Z569 592 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP6NLQ92738 828 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 IWS1Q96ST2 819 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANO3Q9BYT9 981 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL21Q9HBE4 155 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PXMP2Q9NR77 195 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 GABRQQ9UN88 632 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLIC4Q9Y696 253 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 DOCK1Q14185 1865 aa6.05□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PFASO15067 1338 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ASB14A6NK59 587 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 B4DLN1 442 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 MEIS1O00470 390 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 WNT7AO00755 349 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 S1PR4O95977 384 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARP10275 920 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYP3A7P24462 503 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCND2P30279 289 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 MCM7P33993 719 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRIM32Q13049 653 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 AP3B2Q13367 1082 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRM2Q14416 872 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRB14Q14449 540 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARHGEF6Q15052 776 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PGM5Q15124 567 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 STXBP2Q15833 593 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCL14Q16627 93 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRR16Q569H4 304 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTC38Q5R3I4 469 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANO1Q5XXA6 986 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 NEK8Q86SG6 692 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNERQ8NFT8 737 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL31RAQ8NI17 732 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 GJA10Q969M2 543 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 RELTQ969Z4 430 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP28Q96RU2 1077 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.04□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ASTN1O14525 1302 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPTORQ8N122 1335 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM86B1E9PN63 330 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 GREM1O60565 184 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 TDP2O95551 362 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CIITAP33076 1130 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYP2C19P33261 490 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 SREBF1P36956 1147 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 RGS2P41220 211 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 TXKP42681 527 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAPPC10P48553 1259 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 CENPCQ03188 943 aa6.03□□□□□ -1.44
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRKCZQ05513 592 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms