RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 JMYQ8N9B5 988 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PIF1Q9H611 641 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 USP40Q9NVE5 1235 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 DSEQ9UL01 958 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.44□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SLIT2O94813 1529 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ADAMTS20P59510 1910 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 NAT1P18440 290 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 GJA9P57773 515 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PRR31Q5SQ13 230 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDH19Q8TAB3 1148 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CXorf38Q8TB03 319 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 TEPSINQ96N21 525 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CLIC6Q96NY7 704 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM209Q96SK2 561 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 WASF3Q9UPY6 502 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKARQ7Z5J8 1434 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 NRXN1Q9ULB1 1477 aa4.43□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ARVCFO00192 962 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 WNT9AO14904 365 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CRTAMO95727 393 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 GCP02774 474 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 LTFP02788 710 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 FAHP16930 419 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 IL13P35225 146 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 EPHA5P54756 1037 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 MCTP2Q6DN12 878 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 KCTD1Q719H9 257 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 NALCNQ8IZF0 1738 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 TCP11L2Q8N4U5 519 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 FBXW5Q969U6 566 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ZSWIM3Q96MP5 696 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.42□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 B8ZZF3 427 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CYP7B1O75881 506 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 APPP05067 770 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ST5P78524 1137 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 RTP5Q14D33 572 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 VASNQ6EMK4 673 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 FERMT3Q86UX7 667 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 OSTM1Q86WC4 334 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 PROSER1Q86XN7 944 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CD244Q9BZW8 370 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC52A2Q9HAB3 445 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 NDOR1Q9UHB4 597 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 CROTQ9UKG9 612 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 MYO5BQ9ULV0 1848 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD28-211ENST00000492895 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 PRRG2O14669 202 aa4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 GSTA4O15217 222 aa4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 IGSF3O75054 1194 aa4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 EFCAB14O75071 495 aa4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 CKMP06732 381 aa4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 PYGMP11217 842 aa4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 PDE6AP16499 860 aa4.4□□□□□ -1.71
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF28P17035 718 aa4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms