RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 PRCPP42785 496 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CCDC151A5D8V7 595 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ASPHQ12797 758 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 LRRC8CQ8TDW0 803 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SLC16A10Q8TF71 515 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 HGSO14964 777 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 AP3M2P53677 418 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 IL9RQ01113 521 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CEP55Q53EZ4 464 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 LXNQ9BS40 222 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 RABEP2Q9H5N1 569 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SLC16A4O15374 487 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 MFSD14CQ5VZR4 134 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GCNAQ96QF7 691 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 WDR70Q9NW82 654 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 STRIP2Q9ULQ0 834 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA8OA6NCC3 632 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA8NF8WBI6 632 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CCDC188H7C350 402 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 PCK1P35558 622 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 MICALL2Q8IY33 904 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TECPR2O15040 1411 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 S100BP04271 92 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GPC3P51654 580 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 DNAAF3Q8N9W5 541 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 35.3
NISCH-213ENST00000489895 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 ARPP19P56211 112 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 IRX4P78413 519 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 KCNH2Q12809 1159 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 ZSCAN26Q16670 478 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 PLTPP55058 493 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 ZNF699Q32M78 642 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 WHAMMQ8TF30 809 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 FAM151AQ8WW52 585 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 HUS1O60921 280 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 CALB1P05937 261 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 KCNB1Q14721 858 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 STAG2Q8N3U4 1231 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 NUF2Q9BZD4 464 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 ADAM22Q9P0K1 906 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 EYA4O95677 639 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 CYP27A1Q02318 531 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 C16orf86Q6ZW13 317 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 MAP3K14Q99558 947 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GUA9 196 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 TDP2O95551 362 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 VAMP7P51809 220 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 SNX1Q13596 522 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 SPATA33Q96N06 139 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 SLC9A2Q9UBY0 812 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 ZNF609O15014 1411 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 POTEFA5A3E0 1075 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 TBX3O15119 743 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 POTEIP0CG38 1075 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 POTEGQ6S5H5 508 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 MSH2P43246 934 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 EFNA5P52803 228 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 ITPK1Q13572 414 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 ZNF449Q6P9G9 518 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 TEX13BQ9BXU2 312 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 RPS12P25398 132 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 SMARCA1P28370 1054 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 ATP1A2P50993 1020 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 CCSER1Q9C0I3 900 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 SLC8A2Q9UPR5 921 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-213ENST00000489895 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms