RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 TTC28Q96AY4 2481 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 CDKL5O76039 1030 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 LINC00271P0C7V0 271 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 GJD3Q8N144 294 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 LENG9Q96B70 501 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 XBP1P17861 261 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 CLCN3P51790 818 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 PRKCEQ02156 737 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 SLC5A5Q92911 643 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 MGEA5O60502 916 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 GATMP50440 423 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.233e-11■■■■■ 39.9
ACTB-212ENST00000484841 Q4G0T1 1027 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 RDM1Q8NG50 284 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 GPR32O75388 356 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 HYAL1Q12794 435 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 FAM228AQ86W67 206 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 POF1BQ8WVV4 589 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ACTB-212ENST00000484841 C9IYK1 514 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 HOXA2O43364 376 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 ITGB1P05556 798 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 COL19A1Q14993 1142 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 ABI1Q8IZP0 508 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 TDP2O95551 362 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 NDUFV1P49821 464 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 DNM2P50570 870 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 NLRP7Q8WX94 980 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 GJA10Q969M2 543 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 ZNF862O60290 1169 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 MARCH6O60337 910 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 PSMD10O75832 226 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 ALADP13716 330 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 CYP3A7P24462 503 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 CDC42EP1Q00587 391 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 UBE3AQ05086 875 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 CLUL1Q15846 466 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 UGCGQ16739 394 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 MTERF2Q49AM1 385 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 CD320Q9NPF0 282 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 LAG3P18627 525 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 INF2Q27J81 1249 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 LETM2Q2VYF4 491 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 XKR3Q5GH77 459 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 AIFM3Q96NN9 605 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 CD207Q9UJ71 328 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 NCOR1O75376 2440 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 EDIL3O43854 480 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 FGFR1P11362 822 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 DNAJB1P25685 340 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 LTBRP36941 435 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 GPC3P51654 580 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-212ENST00000484841 FAM189BP81408 668 aa22.66■■□□□ 1.22
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