RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SHQ1-208ENST00000482785 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SHQ1-208ENST00000482785 HCN2Q9UL51 889 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1-208ENST00000482785 MTUS1Q9ULD2 1270 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1-208ENST00000482785 SVILO95425 2214 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1-208ENST00000482785 PTPRSQ13332 1948 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1-208ENST00000482785 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1-208ENST00000482785 URB1O60287 2271 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
SHQ1-208ENST00000482785 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa4.71□□□□□ -1.65
SHQ1-208ENST00000482785 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.71□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 TNFRSF10CO14798 259 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 NTSR2O95665 410 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 NME1P15531 152 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 CD33P20138 364 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 ITGA6P23229 1130 aa4.71□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 CYP2C18P33260 490 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 BIRC2Q13490 618 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 DLGAP5Q15398 846 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 CDCP2Q5VXM1 449 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 TRIM22Q8IYM9 498 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa4.71□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 GMCL1Q96IK5 515 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.71□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 REV1Q9UBZ9 1251 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 PTPRFP10586 1907 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 MGAQ8IWI9 3026 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 PDZD2O15018 2839 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 RFX7Q2KHR2 1363 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 A0A1B0GUL7 405 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 CDC14CA4D256 554 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 SLC22A31A6NKX4 558 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 DCDC2CA8MYV0 355 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 TSPAN6O43657 245 aa4.7□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 GP1BBP13224 206 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 RHBDL3P58872 404 aa4.7□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 IKBKEQ14164 716 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 PPP2R5AQ15172 486 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 TCEAL5Q5H9L2 206 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 HDXQ7Z353 690 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 RPAINQ86UA6 219 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 PROSER1Q86XN7 944 aa4.7□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 FLCNQ8NFG4 579 aa4.7□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 CDC6Q99741 560 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 SPOCK3Q9BQ16 436 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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SHQ1-208ENST00000482785 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 NOTCH1P46531 2555 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 TERTO14746 1132 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SHQ1-208ENST00000482785 PLIN1O60240 522 aa4.69□□□□□ -1.66
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