RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 IGBP1P78318 339 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 LMNB2Q03252 620 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 KRT17Q04695 432 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 DSC3Q14574 896 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ACAP1Q15027 740 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SPECC1Q5M775 1068 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 NME8Q8N427 588 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF558Q96NG5 402 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM117Q9H0C3 514 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 DCTPP1Q9H773 170 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 KAT14Q9H8E8 782 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SPG21Q9NZD8 308 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 IRAK3Q9Y616 596 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.32□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SPTLC1O15269 473 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 RPS6KA5O75582 802 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CXCL14O95715 111 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SRFP11831 508 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 KRT76Q01546 638 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ESR2Q92731 530 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 NELL1Q92832 810 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 COL26A1Q96A83 441 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ZBP1Q9H171 429 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 NCDNQ9UBB6 729 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CA14Q9ULX7 337 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.31□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 DENND3A2RUS2 1198 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 KLRF2D3W0D1 207 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 LILRB5O75023 590 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 LRRN2O75325 713 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 PLCB4Q15147 1175 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 LETM2Q2VYF4 491 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC178Q5BJE1 867 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 PPM1JQ5JR12 505 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 FAM228AQ86W67 206 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 LRRC43Q8N309 656 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 PJA1Q8NG27 643 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 GPR152Q8TDT2 470 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 GLG1Q92896 1179 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 EPC1Q9H2F5 836 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 EVPLQ92817 2033 aa8.3□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 PATJQ8NI35 1801 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 A0A0D9SFI3 127 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SLC30A4O14863 429 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 GPR182O15218 404 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CYTH3O43739 400 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CTSAP10619 480 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 MS4A1P11836 297 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 NT5C2P49902 561 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 STARD6P59095 220 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 WTAPQ15007 396 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 NLRX1Q86UT6 975 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CABP7Q86V35 215 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 IQCA1Q86XH1 822 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 VPS52Q8N1B4 723 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 NXPE3Q969Y0 559 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 GPRASP2Q96D09 838 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 FAM227BQ96M60 508 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms