RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ADGRE1Q14246 886 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GPNMBQ14956 572 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SLC39A14Q15043 492 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RAB30Q15771 203 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NTRK3Q16288 839 aa7.04□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 GNPTABQ3T906 1256 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.04□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TIGD1Q96MW7 591 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 H3BRB1 525 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TREHO43280 583 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NBNO60934 754 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PPFIA4O75335 1185 aa7.03□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 CA3P07451 260 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CTSHP09668 335 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 ACTN1P12814 892 aa7.03□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 ZNF165P49910 485 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 NAPAP54920 295 aa7.03□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 DEFB103AP81534 67 aa7.03□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MBTPS1Q14703 1052 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 RILPL1Q5EBL4 403 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SESTD1Q86VW0 696 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.03□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 AFAP1L1Q8TED9 768 aa7.03□□□□□ -1.28
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MITF-215ENST00000478490 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 GPR20Q99678 358 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 KATNAL1Q9BW62 490 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 SETD4Q9NVD3 440 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 MYO7AQ13402 2215 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 C5orf42Q9H799 3197 aa7.03□□□□□ -1.28
MITF-215ENST00000478490 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 C17orf102A2RUQ5 167 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 LCHNA4D1U4 455 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 EPOPA6NHQ4 379 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 BECN2A8MW95 431 aa7.02□□□□□ -1.29
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MITF-215ENST00000478490 OFD1O75665 1012 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 TGFB3P10600 412 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 ITGB5P18084 799 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 MARK3P27448 753 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 CDC25BP30305 580 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 ICAM3P32942 547 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 RFC2P35250 354 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 KCNJ6P48051 423 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP4P98171 946 aa7.02□□□□□ -1.29
MITF-215ENST00000478490 FUT2Q10981 343 aa7.02□□□□□ -1.29
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