RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 PAK2Q13177 524 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 MTMR1Q13613 665 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 KRT32Q14532 448 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 WTAPQ15007 396 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 NECTIN1Q15223 517 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 SYCE2Q6PIF2 218 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 GLG1Q92896 1179 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM87BQ96K49 555 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 CWH43Q9H720 699 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 NFASCO94856 1347 aa8.75□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 C9IYK1 514 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 TK2O00142 265 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PER2O15055 1255 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 MGEA5O60502 916 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 DDAH1O94760 285 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 MCM5P33992 734 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 NBL1P41271 181 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 LIFRP42702 1097 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 GATMP50440 423 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 RCAN1P53805 252 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 KRT76Q01546 638 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PLCB4Q15147 1175 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ODR4Q5SWX8 454 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 KCNB2Q92953 911 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.74□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 CACNA1AO00555 2505 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 SLC27A2O14975 620 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 REC8O95072 547 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 CSPG5O95196 566 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 CALM1P0DP23 149 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 CALM2P0DP24 149 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 CALM3P0DP25 149 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 LAG3P18627 525 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 KIF5BP33176 963 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 GNAQP50148 359 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 STAT5BP51692 787 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 FOSBP53539 338 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ANTXR2P58335 489 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 IGBP1P78318 339 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 FBXL16Q8N461 479 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 AZI2Q9H6S1 392 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 LY9Q9HBG7 655 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 NR2E1Q9Y466 385 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 COL1A2P08123 1366 aa8.73□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 FAM186AA6NE01 2351 aa8.72□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PRR23AA6NEV1 266 aa8.72□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.72□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 H0Y858 1186 aa8.72□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 GPR182O15218 404 aa8.72□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 HBP1O60381 514 aa8.72□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 PPFIA3O75145 1194 aa8.72□□□□□ -1.01
RBBP4-211ENST00000477563 RPS6KA5O75582 802 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms