RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.33■■□□□ 1.17
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COL9A3-210ENST00000472880 AKT3Q9Y243 479 aa22.33■■□□□ 1.17
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COL9A3-210ENST00000472880 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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COL9A3-210ENST00000472880 WDR81Q562E7 1941 aa22.29■■□□□ 1.16
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COL9A3-210ENST00000472880 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.29■■□□□ 1.16
COL9A3-210ENST00000472880 LINC01565O15544 149 aa22.29■■□□□ 1.16
COL9A3-210ENST00000472880 EDIL3O43854 480 aa22.29■■□□□ 1.16
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF862O60290 1169 aa22.29■■□□□ 1.16
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COL9A3-210ENST00000472880 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
COL9A3-210ENST00000472880 NRIP1P48552 1158 aa22.26■■□□□ 1.15
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COL9A3-210ENST00000472880 GALNT17Q6IS24 598 aa22.26■■□□□ 1.15
COL9A3-210ENST00000472880 EFHBQ8N7U6 833 aa22.26■■□□□ 1.15
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