RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.6□□□□□ -1.35
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SHQ1-205ENST00000468371 MAF1Q9H063 256 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-205ENST00000468371 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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SHQ1-205ENST00000468371 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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SHQ1-205ENST00000468371 GPR182O15218 404 aa6.58□□□□□ -1.36
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